研究
微生物与免疫学系的研究分为三个领域(免疫学，微生物相互作用和病毒学)，尽管许多实验室跨越这些部门。该系具有高度的协作性，许多教师共享多项研究经费，一些研究生由两名教师共同指导。
免疫学
本系的免疫学研究课题涉及广泛的领域，主要涉及炎症的调节。正在进行的研究正在评估驱动自身免疫和自身炎症的病原性免疫效应器的发展和分化机制。此外，目前正在进行的工作重点是在微生物病原体的作用下调节炎症的分子。值得注意的是，针对自身抗原和病原体的炎症反应之间存在很多重叠，导致免疫学系之间存在很多交叉授粉。这些基础研究也为开发用于治疗自身免疫、自身炎症和癌症的免疫疗法的转化和临床工作提供了坚实的基础。这些努力导致了高度协作的环境和前沿的基础、转化和临床免疫学研究。
微生物的相互作用
本系在微生物相互作用方面的研究方向包括微生物发病机制、耐药性、信号转导、基因调控、蛋白质分泌、细菌间合作与竞争等。接受调查的微生物包括结核分枝杆菌、金黄色葡萄球菌、艰难梭菌、沙眼衣原体、枯草芽孢杆菌、百日咳杆菌、铜绿假单胞菌、大肠杆菌、鼠疫耶尔森菌、肺炎克雷伯菌、假麦氏伯克霍尔德菌、洋葱伯克霍尔德菌、淋病奈瑟菌、荚膜组织胞浆菌，可引起各种呼吸道、胃肠道和性传播疾病。
病毒学
我们系的病毒学研究与传染病科、遗传学系、莱恩伯格癌症中心、基因治疗中心、公共卫生学院和牙科学院的互补项目密切相关。病毒学部门的重点是艾滋病毒、病毒肿瘤发生(疱疹病毒、HPV和艾滋病毒)、新出现的RNA病毒(Flavi、Corona、Alpha和正粘病毒)和全球健康。医学院和该系在马拉维的利隆圭和尼加拉瓜的莱昂建立了永久的研究伙伴关系，并在亚洲、拉丁美洲和非洲的许多地区建立了其他积极的合作关系。