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作者:罗伯特·巴格内尔(Bagnell@med.unc.edu)病理学和实验室医学

历史:2011/7/01:第一版;2014/8/6:第二版

要求:ImageJ 1.44C或更新

来源:Biosensor_FRETv2.ijm

安装:下载Biosensor_FRETv2。ijm到插件文件夹,重新启动ImageJ。这个宏还需要在ImageJ中安装以下文件:

  • Biosensor_FRET_Names是一个插件,要求用户将开放堆栈的名称分配给Biosensor_FRET期望的名称-可从MSL获得。
  • StackAverage_16是标准ImageJ插件StackAverage的16位版本-可从MSL获得。
  • Infinity_to_zero是一个插件,可以将16位堆栈中的任何像素(65535)设置为0 -可从MSL获得。
  • Shading_Corrector插件从官方ImageJ插件集合
  • SubtractMeasuredBackground从官方ImageJ宏集合
  • TurboReg插件从http://bigwww.epfl.ch/thevenaz/turboreg/
  • DoRT_Curve_Fit_Bob是一个插件,利用内置的ImageJ曲线拟合例程,在Photobleach校正部分做双指数曲线拟合-可从MSL。

描述:这个ImageJ宏处理来自活细胞的延时图像堆栈,这些活细胞使用Klaus Hahn的单链CFP-YFP FRET生物传感器来检测RhoA活性。图像处理步骤在论文中概述:描述活细胞中Rho家族GTPases动态的生物传感器:细胞生物学的当前协议14.11.1-14.11.26,2010年3月。

虽然Hahn生物传感器是创建此宏的动力,但该宏可用于任何表现出FRET的单链生物传感器,其中不需要进行通过修正。宏在源代码中有广泛的文档记录,并在MS Word文档中进行了描述Biosensor_FRET宏描述

下载Biosensor_FRETv2压缩包

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