跳过主要内容

致力于研究的科学家实施先进的生物信息学管道,并为特定项目提供生物信息学支持。该核心由北卡罗来纳大学神经科学中心核心基金和北卡罗来纳大学神经发育障碍临床转化研究中心联合资助。

教师导演:
Mark J. Zylka博士
mark_zylka@med.unc.edu
电话:919-966-2540

生物信息学科学家:
Jeremy M. Simon博士
jeremy_simon@med.unc.edu
电话:919-966-4050

Austin J. Hepperla博士
hepperla@unc.edu
电话:919-966-4068

服务

数据分析和生物学解释越来越频繁地成为阻碍研究人员和学员利用UNC高通量测序设施(HTSF;//m.peseonline.com/genomics)。生物信息学核心旨在通过为nindes资助的研究人员提供从实验设计到其结果的生物学解释的支持,以及帮助实验室和HTSF之间的联系,弥合这一差距。
我们建立定制的软件分析管道和生物信息学工具,以及设计新的分析和数据集成方法,以促进回答神经科学中的前沿问题。
我们专门从事大规模研究,利用以下一项或多项分析,或单独或高水平整合:

  • 基因表达和选择性剪接
  • mRNA-seq(聚+
  • 总rna序列(riboMinus, riboZero)
  • Chromatin-based化验
  • ChIP-seq(转录因子或组蛋白占用)
  • 开放染色质/调控元件
  • DNase-seq(开放染色质/调控元件)
  • ATAC-seq(开放染色质/调控元件)
  • MNase-seq(核小体定位)
  • 基因分型
  • 全基因组测序
  • 外显子组或靶向测序
  • Microbiomics /宏基因组
  • 16 s rRNA

鼓励研究人员联系生物信息学科学家或核心主任,讨论他们的具体需求。

费用

经与核心主管协商确定。